壽山動物園最早於民國六十七年七月一日成立於壽山西麓西子灣，名為「西子灣動物園」，由高雄市公園管理處（現養工處）所屬西子灣風景特定區管理所管轄。民國六十九年，市府爭取中山大學在高雄市復校，將西子灣風景特定區變更為校地，故另於壽山東麓闢建壽山風景區，選定壽山東南角現址設立新園，規劃完成後，於七十年七月廿八日開工歷時五年，於七十五年五月完成園區內全部設施，動物則於七十五年三月進行搬遷，同年六月十五日對外開放參觀。目前壽山動物園隸屬於高雄市風景區管理所管轄。